El Instituto Nacional del Agua tiene una dotación de alrededor de 330 personas e intervino en la planificación de casi todas las represas de la Argentina que hoy se utilizan para generar energía hidroeléctrica, presta servicios a los cinco países de la Cuenca del Plata y hasta realizó estudios técnicos para la ampliación del Canal de Panamá, una de las obras hídricas de mayor envergadura del mundo. Como organismo de referencia nacional e internacional, estudia la prevención de inundaciones y sequías en el territorio, e intervino en los análisis del Río Uruguay durante el conflicto por la instalación de plantas de celulosa, en la primera década de este siglo, entre múltiples otras tareas.
"Hay una indecisión de Gobierno Nacional sobre el Instituto Nacional del Agua"
Juan Carlos Bertoni, expresidente del Instituto Nacional del Agua, expresó su preocupación por el decreto nacional que fusiona el organismo en otra dependencia.